In de Raad van Kerken Enkhuizen participeren de volgende kerken:

Doopsgezinde gemeente

Evangelisch Lutherse gemeente

Leger des Heils

Oud-Katholieke parochie

Protestantse gemeente Enkhuizen

Rooms-Katholieke parochie

Apostolisch Genootschap

Gemeente van Apostolische Christenen

Zevende-dags Adventisten